古菌（拉丁语：Archaea，来自古希腊语：ἀρχαῖα，意为“古代的东西”）又称古细菌、古生菌或太古生物、古核生物，是单细胞微生物，构成生物分类的一个域，或一个界。这些微生物属于原核生物，它们与细菌有很多相似之处，即它们没有细胞核与任何其他膜结合细胞器，同时另一些特征相似于真核生物，比如存在重复串行与核小体。

过去曾经将古菌和细菌一同归为原核生物，并将其命名为“古细菌”，但这种分类方式已过时。事实上古菌有其独特的进化历程，并与其它生命形式有显着的生化差异，所以现在将其列为三域系统中的一个域。在这个系统中，古菌、细菌与真核生物各为一个域，并进一步划分为界与门。到目前为止，古菌已被划分为公认的四个门，随着进一步研究，还可能创建更多的门类。在这些类群中，研究最深入的是泉古菌门与广古菌门。但对古菌进行分类仍然是困难的，因为绝大多数的古菌都无法在实验室中纯化培养，只能通过环境宏基因组检测来分析。

The Archaea (/ɑːrˈkiːə/ or /ɑːrˈkeɪə/ ar-KEE-ə or ar-KAY-ə; singular archaeon) constitute a domain and kingdom of single-celled microorganisms. These microbes are prokaryotes, meaning that they have no cell nucleus or any other membrane-bound organelles in their cells.