日本脑炎疫苗用于预防日本脑炎， 其预防功效可超过90%，持续有效时间不明，似乎会随时间减弱其效力，接种方式可用肌肉注射或皮下注射。

日本脑炎流行国家常将其列入常规疫苗，视疫苗种类进行一到两次的接种，在疫区并不特别需要额外置种疫苗，爱滋病患或怀孕者则需使用灭活疫苗，一般建议需在疫区进行长时户外活动者进行疫苗接种。

此类疫苗相对较安全，注射处可能会有红肿情形，2015年就有15种不同的疫苗可供选择，有些是使用重组ＤNA技术，也有些是使用弱化后的病毒，再其他的则是灭活病毒制成。

日本脑炎疫苗在1930年代发明 刊登于世界卫生组织基本药物标准清单，基础医疗系统中的最重要医疗需求。 在美国一次接种花费100-200美元。

Japanese encephalitis vaccine is a vaccine that protects against Japanese encephalitis. The vaccines are more than 90% effective. How long this protection lasts is not clear but its effectiveness appears to decrease over time. Doses are given either by injection into a muscle or just under the skin.