半知菌（Deuteromycota，希腊语，意思是「第二种真菌」）是一种已废止的生物分类，指在子囊菌・担子菌的同伴之中，还未发现有性繁殖阶段而在分类学上位置不明的一种临时分类。只进行无性繁殖的菌类被称作不完全型，这一阶段被称为无性阶段。进行有性繁殖的被称为完全型，该阶段被称作有性阶段，通常有性阶段的菌类也是同时进行无性生殖的。日常生活中常见的霉菌大部分都处于无性阶段，其中包含半知菌的比率非常高。

此外，一些无性阶段很发达，有性阶段已发现但不常见的子囊菌和担子菌，习惯上也归在半知菌中。

根据G．C．安斯沃斯和G．R．Bisby（1971）的统计，半知菌类有1825属，约2万5千种。这包括很多知名的真菌，例如：生产抗生素的青霉素、引起香港脚的足癣、令食物发酵的酵母菌等都是半知菌。此外，还有一些可食用的半知菌，包括那些令罗克福干酪和卡门培尔奶酪带有其独特个性的真菌。

The Fungi imperfecti or imperfect fungi, also known as Deuteromycota, are fungi which do not fit into the commonly established taxonomic classifications of fungi that are based on biological species concepts or morphological characteristics of sexual structures because their sexual form of reproduction has never been observed; hence the name "imperfect fungi." Only their ****ual form of reproduction is known, meaning that this group of fungi produces their spores ****ually, in the process called sporogenesis.