无孔亚纲（Anapsida）是群羊膜动物，头骨上没有颞颥孔。牠们是爬行动物中最原始的一群，出现于石炭纪晚期。无孔亚纲目前仅存龟鳖目。其他被列为无孔亚纲的生物，米勒古蜥科、夜守龙科、锯齿龙科，都在二叠纪-三叠纪灭绝事件中绝种，只有前棱蜥科仍存活到三叠纪。

无孔亚纲是种传统上的用法，有学者提出这些无孔类动物的彼此关系很远，所以应该被分为几个演化支：出现在晚石炭纪的原始爬行动物（大鼻龙目）、生存在二叠纪的多样性无孔类爬行动物（前棱蜥形目）、以及现存的龟鳖目（海龟、陆龟、水龟）。

最早的龟鳖目化石来自晚三叠纪中国的半甲齿龟（Odontochelys semitestacea），已经很类似现代乌龟。龟鳖目演化自前棱蜥形目、或是双孔亚纲，仍处在争议中。近年有科学家提出，龟鳖目的无孔类形态头颅骨，是种演化逆行现象。这个理论认为龟鳖目演化自双孔类爬行动物，在演化过程中失去两个颞颥孔，但这理论还没被普遍的接受。近期的一些种系发生学研究，根据形态学而将龟憋目归类于双孔亚纲。一些研究人员将龟鳖目列为主龙类的姊妹分类单元，其中多数研究人员是将龟鳖目归类于鳞龙形下纲。仍有研究人员主张龟鳖目是远古无孔类爬行动物的仅存分支，例如：前棱蜥科、锯齿龙科、米勒古蜥科。科学家仍在争论着这些无孔类爬行动物的彼此关系。

An anapsid is an amniote whose skull does not have openings near the temples. Traditionally, the Anapsida are the most primitive subclass of reptiles, the ancestral stock from which Synapsida and Diapsida evolved, making anapsids paraphyletic. It is however doubtful that all anapsids lack temporal fenestra as a primitive trait, and that all the groups traditionally seen as anapsids truly lacked fenestra.